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技术服务

高通量测序服务

发布日期:2013-11-1 14:12:14,浏览次数:0

高通量测序技术是可一次性对几十万到几百万条DNA分子进行并行测序的下一代测序技术(Next Generation Sequencing);其可对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析,使得其在系统生物、功能基因组学、表观遗传学等领域得以广泛应用。
 
高通量测序平台
A、Solexa HiSeq2000
B、454 GS FLX
C、SOLiD 5500xl
 
服务内容
 
1 基因组测序
(1) 基因组de novo测序:对未知的基因组进行从头测序,拼接得到基因组序列,并对其基因组和基因序列进行功能与注释等分析
(2) 基因组重测序:对已知基因组进行重测序,可进行CNV、SNP、染色体结构变异等基因组变异的研究,可以此寻找和疾病,如癌症等,相关的生物标记。
(3) 宏基因组测序:可对某一环境下的所有微生物进行基因组测序,能够揭示微生物群落多样性、种群结构、进化关系、功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系。
(4) 人类外显子组序列捕获与测序:通过外显子捕获技术获得外显子区域DNA序列进行测序,可对各种基因突变进行检测,寻找相关的致病基因和易感基因。

2 转录组测序
(1) 全转录组测序:对某一功能状态下所能转录出来的所有mRNA进行测序,UTRs区域界定、可变剪切研究、低丰度新转录本发现、融合基因鉴定、cSNP(编码序列单核苷酸多态性)等研究
(2) 电子表达谱测序:通过两种酶切作用对基因中一段长度为21nt的序列标签进行测序,可检测各基因的表达量,是研究基因表达谱的经济而快速的研究手段。
(3) 小RNA测序:对长度为21-31nt的内源性非蛋白质编码RNA进行测序,以了解各种小RNA的表达情况,进而对其调控机制进行相关研究。

3 表观基因组测序
(1) ChIP-Seq:通过蛋白免疫相互作用,用抗体把和染色质相互作用的蛋白,如组蛋白、转录因子等,沉淀下来,从而所获取与其相结合的DNA序列,并对所得DNA进行测序,从而对蛋白与基因组DNA相互作用,以及相关基因功能进行研究。
(2) DNA甲基化测序:通过测序对基因组甲基化情况进行研究,进而研究甲基化对基因组功能的调控机制。现有两种方法,一种是MeDIP,是通过与DNA甲基化位点相结合的抗体,进行免疫共沉淀,然后对所得DNA序列进行测序;另一种是Bisulfite Sequencing,是通过Bisulfite处理基因组来区分甲基化位点。
 

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