电话:025-58649515
传真:025-68847340
邮箱:wobio_ord@126.com
QQ:2270953560

技术服务

SNP分型

发布日期:2013-11-1 14:09:30,浏览次数:0

主要应用领域
(1) 复杂疾病的易感性基因分析与基因定位;
(2) 个体识别与法医鉴定;
(3) 环境因子易感基因的检出与病原体基因分析;
(4) 系统发育分析与病理分子遗传机理的阐明;
(5) 药物开发与个体用药;
(6) 生物进化与遗传分析。

实验方法
(1) 连接酶检测反应(LDR)分型方法
    主要应用连接酶检测反应 (ligase detection reaction,LDR)技术。即在Taq DNA连接酶的作用下,当SNP位点上下游两条寡核苷酸探针与目的DNA序列完全互补,并且两条探针之间没有空隙时才能发生连接反应,否则连接反应不能进行,最后通过荧光扫描片段长度,实现对SNP 位点的检测。
(2) 多重SnaPshot SNP分型方法
    在一个含有测序酶,四种荧光标记的ddNTP,紧挨多态位点5’端的不同长度延伸引物和PCR产物模板的反应体系中,引物延伸一个碱基即终止,经ABI测序仪跑胶后,根据峰的颜色可知掺入的碱基种类,从而确定该样本的基因型,根据峰移动的胶位置确定该延伸产物对应的SNP位点。对于PCR产物模板可通过多重PCR反应体系来获得。
(3) Taqman探针分型方法
    应用一对双标记Taqman探针,分别针对双等位SNP的不同基因型,只有完全匹配的探针扩增出各自对应的基因型;用两种荧光染料Fam,Hex(Vic)分别标记这两种探针,就可以在一次PCR反应中完成对单个SNP位点的基因型判定。
(4) MassARRAY 分型方法
    Sequenom MassArray系统主要是利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 (MALDI-TOF MS) 进行分析,即PCR扩增产物或者预处理样本在延伸单碱基后,将制备的样品分析物与芯片基质共结晶,将该晶体放入质谱仪的真空管,而后用瞬时纳秒 (10-9s)强激光激发,由于基质分子经辐射所吸收的能量,导致能量蓄积并迅速产热,从而使基质晶体升华,核酸分子就会解吸附并转变为亚稳态离子,产生的离子多为单电荷离子,这些单电荷离子在加速电场中获得相同的动能,进而在一非电场漂移区内按照其质荷比率得以分离,在真空小管中飞行到达检测器,从而可以分析鉴定。

服务内容
(1) 课题的设计咨询;样本的质检; 
(2) LDR分型或SNaPshot SNP分型或Taqman 探针分型法或Mass ARRAY 分型方法;
(3) 分型所用引物的设计、合成与优化;
(4) 分型数据的质量评估。

需要客户提供
(1) SNP位点信息:SNP位点的rs号;或SNP位点上下游各200bp的确切序列及SNP位点突变的类型。
(2) 分型样品:基因组DNA、质粒DNA、 血样血斑等。

我们提交的结果
(1) SNPs结果(ExceL表格);
(2) 扩增和反应体系、所涉及的引物、探针序列;
(3) 原始SNP峰型图;
(4) 分型数据的质量评估报告。
 

 

打印】【关闭

哪里有卖银行卡哪里可以买银行卡

出售全新工、农、建、招、诚信合作安全全新办理各大行银行卡,全新开户安全无任何记录。QQ:【24小时在线QQ:675321570】